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上海交通大學李健課題組JACS:化學酶法實現Labdane型骨架氧化態(tài)自由

來源:上海交通大學      2024-09-24
導讀:近日,上海交通大學李健課題組在JACS上發(fā)表了題為:“Chemoenzymatic Oxidation of Labdane and Formal Synthesis of Nimbolide”的研究論文,綜合運用酶庫篩選、定向進化和連續(xù)化學氧化實現了labdane型骨架母核的全面氧化。此外,為了展示化學酶法氧化在實際合成中的可行性以及線性合成復雜天然產物的潛力,李健團隊完成了nimbolide形式合成。


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正文

選擇性C-H氧化反應代表著有機合成中最重要也最具挑戰(zhàn)的轉化,化學法實現選擇性C-H氧化反應大多需要借助導向基實現。相較于化學方法,酶催化的C-H氧化既擁有高選擇性,也展示出對官能團的低依賴與高兼容性。值得一提的是,底物在無保護基的前提下就可能實現酶的連續(xù)C-H氧化??紤]到上述優(yōu)點,逆合成分析中,使用生物催化引入氧化態(tài)的方式受到了學術界與工業(yè)界的廣泛關注。在天然產物中,具有較高活性的分子往往也是相應家族中氧化態(tài)較高的分子。以labdane及相近的drimane骨架為例,具有生物活性的化合物如nimbolide和forskolin相較于沒有氧化態(tài)的母核(化合物19, 圖1),分別具有6個和9個氧化態(tài)。為了實現labdane型骨架氧化態(tài)的引入,許多課題組使用化學或生物催化的手段對商業(yè)易得的香紫蘇內酯、香紫蘇醇和降龍涎香進行了C-H氧化的嘗試并且取得了不錯的效果(圖1)。然而,由于不同方法適用底物不同,在同一個底物上連續(xù)引入氧化態(tài)仍然存在巨大的挑戰(zhàn)。

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圖1:部分labdane型與杜馬烷型骨架天然產物與labdane型骨架C-H氧化研究進展

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圖2:化合物1, 2, 3, 18, 19的酶庫篩選結果

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圖3:化合物20的酶庫篩選結果

為了實現酶和化學方法的連續(xù)氧化,李健團隊首先對六個具有labdane型骨架的,商業(yè)可得或易于制備的化合物(123181920, 圖2)進行了酶庫的篩選,并最終選取了氧化產品更豐富的脫氫香紫蘇內酯(20, 圖3)作為底物,展開了后續(xù)定向進化與連續(xù)氧化的嘗試。

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圖4:α-KG依賴的雙加氧酶AndA的定向進化。a. AndA野生型的定向進化。b. 天然底物與AndA野生型共晶中的結合姿態(tài)與活性位點氨基酸殘基。c. 本報道中9,11-脫氫香紫蘇內酯酶法C-H氧化的總結

由于AndA對脫氫香紫蘇內酯氧化效率低,通過分析已知文獻報道的AndA的晶體(圖4b),李健團隊首先選取酶活性中心附近的三個大位阻氨基酸(69與70位的異亮氨酸和139位的亮氨酸)進行了飽和突變。其中,69位異亮氨酸突變成酪氨酸后,AndA的轉化率明顯提升,且生成C6α羥基的產品?;谠撏蛔凅w,對120號氨基酸和138號氨基酸進行飽和突變,分別得到了單一的C6α羥基和C1α羥基的產品3837(圖4a)。至此,李健團隊實現了脫氫香紫蘇內酯C1、C2、C3、C5和C6位點的選擇性氧化(圖4c)。

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圖5:基于化合物20的酶法和化學接力氧化

在得到上述氧化產品以及實現位點選擇性氧化的酶后,李健團隊綜合運用酶法和化學方法連續(xù)氧化,得到如圖5所示的二十個基于脫氫香紫蘇內酯的多位點全面氧化的產品。其中,化合物38可以通過Suarez和AndA突變體的C-H氧化得到具有nimbolide A/B環(huán)骨架與C1氧化態(tài)的中間體55

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圖6:無保護基的Nimbolide形式合成

為了展示化學酶法C-H氧化的可行性,李健課題組選取化合物55作為前體,經過9步,實現了nimbolide的形式合成(圖6)。


總結

綜上所述,李健團隊通過酶庫篩選與定向進化實現了脫氫香紫蘇內酯位點選擇性的C-H氧化。在確定這些功能獨特的酶后,綜合運用酶和化學方法在單氧化態(tài)產品上連續(xù)氧化,得到了二十個脫氫香紫蘇內酯全面氧化的衍生物。這種協(xié)同氧化的策略實現了labdane型骨架A/B環(huán)系所有位點氧化態(tài)的精準引入。通過使用中間體55,李健團隊實現了nimbolide高效形式合成。這種整合了酶庫篩選、定向進化與化學轉化的變革性的逆合成策略為構筑其他具有復雜氧化態(tài)的萜類、甾體和生物堿類天然產物提供了范例。


作者簡介

李健,上海交通大學變革性分子前沿科學中心長聘教軌副教授,博士研究生導師。博士畢業(yè)于上海有機所(導師:李昂研究員),后在美國斯克里普斯研究所從事博士后研究工作(合作導師:Hans Renata教授)。2022年加入上海交通大學變革性分子前沿科學中心,獲評國家海外高層次青年人才。目前已在Nature Chemistry、JACS、Angewandte Chemie、Nature Communication等學術刊物發(fā)表論文20余篇。研究領域:天然產物化學酶法合成、手性藥物化學酶法合成和蛋白質定向進化。

課題組主頁:lilabsjtu.com

根據課題組發(fā)展需要,2025年擬招聘天然產物全合成方向博士研究生2名,酶學或發(fā)酵工程方向博士研究生1名。有意應聘者請將簡歷發(fā)送到電子郵箱:jianlizcz@sjtu.edu.cn。

文獻詳情:

Chemoenzymatic Oxidation of Labdane and Formal Synthesis of Nimbolide
Xiaotao Liu, Yaoyao Xu, Lingling Li, Jian Li*
J. Am. Chem. Soc. 2024

https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.4c07956

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