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北航常凌乾團隊《PNAS》:納米細胞芯片,精準篩選肺癌免疫治療獲益人群

來源:北京航空航天大學      2024-05-07
導讀:免疫療法是當前最具臨床前景的腫瘤治療方式之一,曾獲2018年諾貝爾生理醫(yī)學獎。該療法采用PD-L1抑制劑等免疫檢查點抑制劑(ICI),重新激活癌癥患者體的免疫細胞,從而提高對腫瘤細胞的識別和清除能力。但在臨床中,僅有部分患者能從免疫治療中獲益。導致獲益率差的主要原因之一是,臨床常規(guī)組織活檢,受限于取樣位和檢測的精準性,無法準確評估腫瘤的異質性。同時,僅依靠單一免疫標記物(如 PD-L1),無法準確預測患者對 ICI反饋。因此,如何精準預測免疫治療的療效,成為了個性化精準免疫治療面臨的首要問題。

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針對該臨床問題,北京航空航天大學常凌乾團隊報道了一種新型納米醫(yī)療芯片,可以快速檢測肺癌循環(huán)腫瘤細胞(CTCs)內PD-L1基因表達、以及腫瘤細胞響應免疫細胞的行為表型;進一步對患者來源的CTCs進行亞群劃分,依此預測肺癌患者對免疫療法的治療效果。與傳統(tǒng)組織活檢技術相比,臨床準確率(AUC值)由57%顯著提高到90%以上。成果以“Genetic and phenotypic profiling of single living circulating tumor cells from patients with microfluidics”為題,發(fā)表在《PNAS》上。

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圖1. 循環(huán)腫瘤細胞(CTCs)捕獲、原位培養(yǎng)和基因分析芯片系統(tǒng)NICHE,用于肺癌免疫治療的精準預測與監(jiān)測。

該納米芯片采用磁場和細胞尺寸,高效去除(> 93%)血樣中的白細胞,并捕獲CTCs使其形成單細胞陣列(>95%)。為了實現(xiàn)活CTCsPD-L1基因的準確檢測,研究者們設計了一種具有四面體結構的探針,實現(xiàn)對活細胞內PD-L1基因、內參GAPDH基因、以及CTCs鑒定基因的同時檢測。芯片采用實驗室標簽遞送技術——納米電穿孔,在2秒內將探針遞送至95%細胞內,且保持良好的細胞安全性(90%),遞送性能顯著優(yōu)于與其他常規(guī)方法(2)。

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圖2. 在單個活細胞水平CTCs內PD-L1 mRNA的精準量化。

完成基因檢測的CTCs,保持了良好的活性。通過與免疫T細胞的共培養(yǎng),研究者們發(fā)現(xiàn),部分腫瘤細胞在免疫抑制劑存在時,細胞形態(tài)發(fā)生了明顯的變長,且細胞增殖行為被顯著抑制3)。根據(jù)腫瘤細胞PD-L1的表達情況,研究者們劃分出了PD-L1高表達與低表達的閾值;另外,根據(jù)腫瘤細胞與免疫細胞共培養(yǎng)的結果,研究者們劃分出了腫瘤細胞形態(tài)發(fā)生變化的閾值。綜合CTCsPD-L1高表達(PD-L1high)且表型發(fā)生變化(PA+)的占比,該研究定義了一種新的指標,“NICHE指數(shù)”,用于預測癌癥患者響應免疫療法的療效。

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圖3. CTCs與免疫細胞共培養(yǎng)下發(fā)生形態(tài)改變。

為了評估NICHE在臨床上預測免疫療效的性能,收集了80 名非小細胞肺癌患者的外周血,通過在NICHE平臺上的檢測,證明了該平臺捕獲 CTCs 并鑒定其基因和行為表型的能力(4。NICHE指數(shù)在預測臨床預后方面,表現(xiàn)出高準確性(AUC=0.906,明顯高于目前臨床上基于腫瘤組織中PD-L1表達細胞占比的標準參考方法(AUC=0.578)。目前,該團隊正在聯(lián)合北大腫瘤醫(yī)院吳楠主任,制定一項行業(yè)標準,用于肺癌免疫治療獲益人群篩選,以達到肺癌個性化醫(yī)療,有望降低臨床癌癥醫(yī)療負擔。

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圖4. 采用NICHE系統(tǒng)對肺癌血樣中的CTCs進行捕獲與分析,并實現(xiàn)了患者免疫治療的精準預測。

該論文的其他通訊作者包括北京大學腫瘤醫(yī)院吳楠教授、格拉斯哥大學Jonathan M. Cooper 教授、北京機械設備研究所楊明珠研究員。第一作者為北航醫(yī)學科學與工程學院董再再(助理教授)、北航生物與醫(yī)學工程學院汪于森碩士、北京大學腫瘤醫(yī)院劉冰博士、上海市感染和免疫疾病科技創(chuàng)新中心徐高連教授。

文章鏈接:https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2315168121


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