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南京大學(xué)黃小強(qiáng)/梁勇及合作者《Nature》發(fā)文:創(chuàng)制新光酶元件,引領(lǐng)光生物制造新方向

來(lái)源:南京大學(xué)      2023-12-19
導(dǎo)讀:南京大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院黃小強(qiáng)特聘研究員,與化院梁勇教授、中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)/中國(guó)科學(xué)院強(qiáng)磁場(chǎng)科學(xué)中心田長(zhǎng)麟教授合作《Nature》發(fā)文,創(chuàng)制新光酶元件,引領(lǐng)光生物制造新方向。

南京大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院黃小強(qiáng)特聘研究員,與化院梁勇教授、中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)/中國(guó)科學(xué)院強(qiáng)磁場(chǎng)科學(xué)中心田長(zhǎng)麟教授合作,開(kāi)發(fā)了焦磷酸硫胺素(ThDP)依賴(lài)酶和光催化協(xié)同的雙催化新體系,該體系是自然界中全新的、現(xiàn)有化學(xué)方法難以實(shí)現(xiàn)的全新分子生化體系,不僅極大地?cái)U(kuò)展了酶的催化功能、為綠色生物制造提供了豐富元件,還為化學(xué)領(lǐng)域的手性精準(zhǔn)控制難題提供了新策略,有望引領(lǐng)光生物制造新方向。成果以“A light-driven enzymatic enantioselective radical acylation”為題,2023年12月18日在線(xiàn)發(fā)表于Nature期刊。

作為當(dāng)下中美大國(guó)競(jìng)爭(zhēng)的焦點(diǎn)領(lǐng)域,生物制造是變革工業(yè)可持續(xù)發(fā)展最有希望的綠色技術(shù)之一。然而,生物制造的“芯片”——酶,面臨催化功能相對(duì)有限、我國(guó)的自主率低等問(wèn)題。如何創(chuàng)制新酶元件、解決當(dāng)前合成面臨的問(wèn)題,是化學(xué)研究的科技前沿?zé)狳c(diǎn)。

在自然界中,焦磷酸硫胺素依賴(lài)的苯甲醛裂解酶,催化的是雙電子的(可逆的)苯甲醛到安息香的轉(zhuǎn)化。受這一類(lèi)酶的啟發(fā),合成化學(xué)家發(fā)展了一系列仿生氮雜環(huán)卡賓催化劑,并于近期用于催化自由基反應(yīng)。綜合利用仿生和化學(xué)模擬的思路(圖1),研究團(tuán)隊(duì)利用可見(jiàn)光激發(fā)和定向進(jìn)化手段,將ThDP依賴(lài)的苯甲醛裂解酶“重塑”為自由基?;D(zhuǎn)移酶(RAT),實(shí)現(xiàn)了一例非天然的高對(duì)映選擇性的自由基-自由基偶聯(lián)反應(yīng)。該成果首次將ThDP依賴(lài)酶用于催化非天然的自由基轉(zhuǎn)化,同時(shí)實(shí)現(xiàn)了有機(jī)氮雜環(huán)卡賓催化不能達(dá)到的低催化劑負(fù)載量和高立體選擇性的效果。

圖1:融合化學(xué)與生物,開(kāi)發(fā)新生物合成體系

團(tuán)隊(duì)以4-甲氧基苯甲醛1a和自由基前體氧化還原活性酯2a作為模板底物,探索了有機(jī)染料曙紅Y和ThDP依賴(lài)酶的催化體系。隨后通過(guò)分子動(dòng)力學(xué)模擬和半理性設(shè)計(jì)構(gòu)建了小而精的突變體庫(kù),能夠快速、低成本地獲取最優(yōu)突變體酶。該體系有非常好的底物耐受性,能夠接受的底物包括各種鄰、間、對(duì)位取代的芳香醛、雜環(huán)芳香醛和各種取代基的羧酸衍生物。文章展示了35個(gè)例子,對(duì)映選擇性最高達(dá)97% ee,凸顯了酶可調(diào)的活性口袋對(duì)于游離自由基立體化學(xué)的精妙調(diào)控作用。

2:底物譜拓展

團(tuán)隊(duì)對(duì)該雙催化體系提出了機(jī)理假設(shè)在綠光照射下,激發(fā)態(tài)曙紅Y選擇性地氧化酶口袋內(nèi)的Breslow中間體,生成焦磷酸硫胺素結(jié)合的穩(wěn)態(tài)自由基,同時(shí)氧化還原活性酯類(lèi)的自由基前體以生物兼容的方式在體系中產(chǎn)生瞬態(tài)自由基,從而在酶口袋內(nèi)發(fā)生非天然的酶促自由基-自由基交叉偶聯(lián)反應(yīng)。研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)機(jī)理濕實(shí)驗(yàn)、電子順磁共振譜學(xué)研究和理論計(jì)算等方法,對(duì)機(jī)理開(kāi)展了詳細(xì)研究,揭示了新酶反應(yīng)性的關(guān)鍵以及高立體化學(xué)選擇性的來(lái)源。詳細(xì)內(nèi)容請(qǐng)參考原文。

該工作第一通訊單位為南京大學(xué)配位化學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、化學(xué)和生物醫(yī)藥創(chuàng)新研究院、化學(xué)化工學(xué)院。南京大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院博士研究生許園園、南京大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院特任副研究員陳紅威和中國(guó)科學(xué)院強(qiáng)磁場(chǎng)科學(xué)中心于璐副研究員為論文的共同第一作者;梁勇教授和田長(zhǎng)麟教授為論文的共同通訊作者;黃小強(qiáng)特聘研究員為最后通訊作者。該工作得到了南京大學(xué)啟動(dòng)經(jīng)費(fèi)、科技部重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃(2022YFA0913000, 2019YFA0405600)、國(guó)家自然科學(xué)基金(21825703, 21927814, 22277053)、江蘇省自然科學(xué)基金(BK20220760, BK20230018)等項(xiàng)目的支持。


論文鏈接: https://www.nature.com/articles/s41586-023-06822-x


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