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北大陳興課題組Nat Chem Biol 實(shí)現(xiàn)動(dòng)物活體中的細(xì)胞特異性糖質(zhì)標(biāo)記與分析

來(lái)源:北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院      2022-05-07
導(dǎo)讀:5月5日,北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院、北大-清華生命科學(xué)聯(lián)合中心陳興課題組在Nature Chemical Biology上發(fā)表了題為Cell-type-specific labeling and profiling of glycans in living mice的論文,報(bào)道了一種可基因編碼的代謝糖質(zhì)標(biāo)記技術(shù)(GeMGL)。

生物體中幾乎所有的細(xì)胞都具有相同的基因組,而不同的細(xì)胞類型和功能則由不同的基因表達(dá)、表觀遺傳修飾和翻譯后修飾等所決定。解析特定器官或組織中特定細(xì)胞的生物大分子圖譜對(duì)于探究發(fā)育、細(xì)胞間通訊以及疾病的發(fā)生發(fā)展等都具有重要意義。因此,開(kāi)發(fā)細(xì)胞選擇性的生物大分子標(biāo)記方法,近年來(lái)受到了科學(xué)家們的廣泛關(guān)注1。通過(guò)基因編碼的方法,人們?cè)诨铙w動(dòng)物中實(shí)現(xiàn)了蛋白質(zhì)的組織特異性和細(xì)胞選擇性標(biāo)記和分析2,3。然而,糖質(zhì)(glycan)作為另外一種主要的生物大分子,尚無(wú)法通過(guò)基因編碼的方式,實(shí)現(xiàn)活體中的細(xì)胞選擇性標(biāo)記。

糖質(zhì)以寡糖、多糖、糖蛋白、糖脂等形式直接參與細(xì)胞的分化增殖、免疫調(diào)節(jié)、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞遷移等重要的生命活動(dòng),對(duì)其進(jìn)行在體標(biāo)記和分析一直是領(lǐng)域內(nèi)的一個(gè)難點(diǎn)4。其中,基于生物正交化學(xué)的代謝糖質(zhì)標(biāo)記(metabolic glycan labeling)技術(shù)已經(jīng)成為了最主要的工具之一。經(jīng)過(guò)二十多年的發(fā)展,目前已有數(shù)十種非天然糖分子可用以在活細(xì)胞和活體中標(biāo)記糖質(zhì)。然而,非天然糖在活體中并不具備器官或細(xì)胞特異性,無(wú)法實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)的細(xì)胞選擇性標(biāo)記,闡釋特定細(xì)胞群體中糖質(zhì)所發(fā)揮的生物學(xué)功能。北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院、北大-清華生命科學(xué)聯(lián)合中心陳興課題組一直致力于解決這個(gè)問(wèn)題,此前開(kāi)發(fā)了基于靶向性脂質(zhì)體的非天然糖代謝標(biāo)記技術(shù),實(shí)現(xiàn)了腫瘤組織和腦部的糖質(zhì)標(biāo)記5,6。同時(shí),他們意識(shí)到,基因編碼技術(shù)可以在活體中實(shí)現(xiàn)更加精準(zhǔn)的細(xì)胞選擇性。為了實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo),繼續(xù)推進(jìn)代謝糖質(zhì)標(biāo)記技術(shù)的應(yīng)用,202255日,該課題組在Nature Chemical Biology上發(fā)表了題為Cell-type-specific labeling and profiling of glycans in living mice的論文,報(bào)道了一種可基因編碼的代謝糖質(zhì)標(biāo)記技術(shù)(GeMGL)。該技術(shù)將凸凹互補(bǔ)(bump and hole的化學(xué)遺傳學(xué)策略與代謝糖質(zhì)標(biāo)記方法相結(jié)合,利用非天然糖1,3-Pr2GlcNAlBump)及其匹配的焦磷酸酶突變體AGX2F383GHole)的正交組合,在活體動(dòng)物上實(shí)現(xiàn)了細(xì)胞選擇性糖質(zhì)標(biāo)記和分析。

他們從一個(gè)具有低標(biāo)記效率的非天然糖乙酰胺基葡萄糖的疊氮類似物GlcNAz出發(fā),確認(rèn)了其代謝通路中的焦磷酸酶AGX是限速酶,將其過(guò)表達(dá)可以增強(qiáng)代謝強(qiáng)度。他們隨即想到,增大非天然基團(tuán)并對(duì)AGX酶進(jìn)行突變,可能可以開(kāi)發(fā)出凹凸對(duì)。于是,他們采用了炔基修飾的乙酰胺基葡萄糖GlcNAl和焦磷酸酶突變體AGX2F383G,通過(guò)體外和細(xì)胞實(shí)驗(yàn)證明了GlcNAl的代謝完全依賴焦磷酸酶突變體AGX2F383G。接著,在多細(xì)胞共培養(yǎng)體系和小鼠移植瘤模型中,證明了GeMGL策略的可行性。

基于此,他們將該策略拓展到了轉(zhuǎn)基因小鼠中。他們首先利用心肌細(xì)胞特異的啟動(dòng)子α-MHC實(shí)現(xiàn)了AGX2F383G在小鼠心肌細(xì)胞中的特異性表達(dá),然后腹腔注射非天然糖1,3-Pr2GlcNAl,實(shí)現(xiàn)了非天然糖分子在小鼠心肌細(xì)胞中的特異性代謝。從各組織標(biāo)記結(jié)果來(lái)看,GeMGL策略展現(xiàn)出嚴(yán)格的心肌細(xì)胞選擇性。結(jié)合定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法,在小鼠心肌細(xì)胞中鑒定到582個(gè)O-GlcNAc修飾蛋白。分析發(fā)現(xiàn),心肌細(xì)胞中許多糖酵解、TCA循環(huán)和氧化磷酸化途徑相關(guān)蛋白都具有O-GlcNAc糖基化修飾,表明O-GlcNAc糖基化修飾可能在心肌細(xì)胞的線粒體能量代謝過(guò)程中發(fā)揮重要功能。

陳興課題組長(zhǎng)期致力于糖化學(xué)和糖生物學(xué)研究,糖質(zhì)標(biāo)記和分析是其研究重點(diǎn)之一。該工作提供了一種可基因編碼的細(xì)胞特異性糖質(zhì)標(biāo)記技術(shù)GeMGL,為在活體層面研究糖質(zhì)在特定細(xì)胞類型中的生物學(xué)功能提供了一種便利、有效的工具。該技術(shù)有望被推廣到更為復(fù)雜的神經(jīng)系統(tǒng)中,并在相關(guān)疾病模型中探究糖基化與神經(jīng)發(fā)育、神經(jīng)退行性疾病等的關(guān)系。

北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院、北大-清華生命科學(xué)聯(lián)合中心的陳興教授為該論文的通訊作者,化學(xué)院已畢業(yè)博士生范欣琦和生命科學(xué)聯(lián)合中心博士生宋其濤為論文的共同第一作者。該研究工作得到了國(guó)家自然科學(xué)基金委、科技部、北大-清華生命科學(xué)聯(lián)合中心和北京分子科學(xué)國(guó)家研究中心的資助。

原文連接:https://www.nature.com/articles/s41589-022-01016-4.

參考文獻(xiàn)

 

1. Xie, R., Hong, S. & Chen, X. Cell-selective metabolic labeling of biomolecules with bioorthogonal functionalities. Curr Opin Chem Biol 17, 747–752 (2013).

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3. Krogager, T. P. et al. Labeling and identifying cell-specific proteomes in the mouse brain. Nat Biotechnol 36, 156–159 (2018).

4. Cheng, B., Tang, Q., Zhang, C. & Chen, X. Glycan Labeling and Analysis in Cells and In Vivo. Annu Rev Anal Chem 14, 363–387 (2021).

5. Xie, R. et al. Targeted Imaging and Proteomic Analysis of Tumor‐Associated Glycans in Living Animals. Angewandte Chemie Int Ed 53, 14082–14086 (2014).

6. Xie, R. et al. In vivo metabolic labeling of sialoglycans in the mouse brain by using a liposome-assisted bioorthogonal reporter strategy. Proc National Acad Sci 113, 5173–5178 (2016).


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