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2022年1月6日，南方科技大學(xué)生物系、冷凍電鏡中心研究教授王培毅團(tuán)隊(duì)聯(lián)合中國(guó)科學(xué)院微生物研究所等單位在國(guó)際頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊《細(xì)胞》（Cell）雜志在線發(fā)表了題為“Receptor binding and complex structures of human ACE2 to spike RBD from Omicron and Delta SARS-CoV-2”的研究論文，首次解析了新冠病毒兩個(gè)關(guān)鍵突變株Omicron 和Delta RBD區(qū)（關(guān)鍵受體結(jié)合區(qū)）與人ACE2（hACE2）的復(fù)合物結(jié)構(gòu)，闡明了其相互作用的分子機(jī)制。
王培毅和中國(guó)科學(xué)院微生物研究所高福院士、研究員齊建勛為論文共同通訊作者。中國(guó)科學(xué)院微生物研究所博士后韓鵬程、中國(guó)科學(xué)院微生物研究所博士生李霖杰、南方科技大學(xué)冷凍電鏡中心博士后劉升、上海同步輻射光源研究員汪啟勝和中國(guó)科學(xué)院大學(xué)與澳門大學(xué)聯(lián)合培養(yǎng)博士生張弟為論文共同第一作者。我校生物系、冷凍電鏡中心是第一作者和第一通訊單位。
新冠病毒突變株Omicron和Delta目前是世界衛(wèi)生組織定義的五種“關(guān)切變異株（VOC）”中最重要的兩種。Omicron已在128個(gè)國(guó)家和地區(qū)出現(xiàn)，因此引起了全球廣泛關(guān)注，其突變株刺突S蛋白上最關(guān)鍵的受體結(jié)合域RBD攜帶高達(dá)15個(gè)氨基酸突變，涵蓋了Alpha、Beta、Gamma突變株具備的所有特征。Delta變異株是迄今發(fā)現(xiàn)的最具傳播性的新冠變異株。深入理解Omicron和Delta突變株的識(shí)別受體和入侵細(xì)胞的機(jī)制是疫苗和藥物研發(fā)的關(guān)鍵基礎(chǔ)。
研究團(tuán)隊(duì)首先通過流式細(xì)胞分析、表面等離子共振和假病毒入侵實(shí)驗(yàn)等定性、定量的研究方法，評(píng)估了五種VOC與hACE2的結(jié)合能力和假病毒感染能力。研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)，與新冠病毒原型毒株（GISAD: EPI_ISL_402119）相比，Omicron 和Delta突變株的RBD與hACE2的結(jié)合能力沒有明顯變化。為進(jìn)一步探明Omicron RBD 和Delta RBD 與hACE2相互作用的分子機(jī)制，研究團(tuán)隊(duì)解析了Omicron RBD/hACE2復(fù)合物的冷凍電鏡結(jié)構(gòu)（3.4 ?）和X-射線晶體結(jié)構(gòu)（3.0 ?），同時(shí)還獲得了Delta RBD/hACE2復(fù)合物的X-射線晶體結(jié)構(gòu)（3.35 ?）（見圖）。結(jié)構(gòu)分析表明，Omicron RBD上的Q493R和Q498R的突變使其周圍的相互作用網(wǎng)絡(luò)發(fā)生了重排，K417N, G446S, E484A, G496S和 Y505H突變均削弱了Omicron RBD與hACE2的結(jié)合能力，N501Y的突變使其與hACE2上的Y41位形成 π-π相互作用而增強(qiáng)其與hACE2的親和力。Delta RBD上的兩個(gè)突變位點(diǎn)，L452R和T478K，從結(jié)構(gòu)上看，兩個(gè)位點(diǎn)不影響其與hACE2的結(jié)合，但是可能會(huì)影響抗體的結(jié)合，對(duì)部分現(xiàn)有抗體產(chǎn)生免疫逃逸。
本研究揭示了目前最受關(guān)注的兩個(gè)新冠突變株Omicron和Delta的RBD與hACE2相互作用的分子機(jī)制，為疫苗研發(fā)和藥物篩選奠定了分子基礎(chǔ)。
圖1.Omicron RBD 和Delta RBD與hACE2復(fù)合物結(jié)構(gòu)
該研究得到了科技部國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、深圳市科技創(chuàng)新委員會(huì)基金、南方科技大學(xué)校長(zhǎng)卓越博士后等項(xiàng)目的資助。該研究主要數(shù)據(jù)收集和處理工作均在南方科技大學(xué)冷凍電鏡中心完成，并得到南科大生物系和冷凍電鏡中心多位老師的大力支持。
論文鏈接：https://doi.org/10.1016/j.cell.2022.01.001
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