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兩篇ACS Central Science背靠背文章:雷曉光課題組發(fā)文闡述 “后期多樣化衍生策略”在天然產(chǎn)物合成與創(chuàng)新藥物研發(fā)中的應(yīng)用

來源:北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院      2020-05-08
導(dǎo)讀:活性天然產(chǎn)物在合成化學(xué)發(fā)展、生物醫(yī)學(xué)研究與創(chuàng)新藥物發(fā)現(xiàn)中一直扮演著重要角色。過去三十年中,接近50%的新上市創(chuàng)新藥物來源于天然產(chǎn)物或其衍生物。天然產(chǎn)物的衍生化對構(gòu)效關(guān)系研究和藥物活性優(yōu)化至關(guān)重要,而直接通過選擇性的官能團(tuán)化對天然產(chǎn)物進(jìn)行后期衍生改造無疑是最經(jīng)濟(jì)高效的方法。此外,對于天然產(chǎn)物的后期衍生化也有助于快速、有效地構(gòu)造出化學(xué)探針,幫助開展化學(xué)生物學(xué)研究,揭示新的生物靶點(diǎn)和作用機(jī)制。

活性天然產(chǎn)物在合成化學(xué)發(fā)展、生物醫(yī)學(xué)研究與創(chuàng)新藥物發(fā)現(xiàn)中一直扮演著重要角色。過去三十年中,接近50%的新上市創(chuàng)新藥物來源于天然產(chǎn)物或其衍生物。天然產(chǎn)物的衍生化對構(gòu)效關(guān)系研究和藥物活性優(yōu)化至關(guān)重要,而直接通過選擇性的官能團(tuán)化對天然產(chǎn)物進(jìn)行后期衍生改造無疑是最經(jīng)濟(jì)高效的方法。此外,對于天然產(chǎn)物的后期衍生化也有助于快速、有效地構(gòu)造出化學(xué)探針,幫助開展化學(xué)生物學(xué)研究,揭示新的生物靶點(diǎn)和作用機(jī)制。 

近年來,隨著有機(jī)合成方法學(xué)與生物酶催化技術(shù)的蓬勃發(fā)展,涌現(xiàn)出很多在復(fù)雜底物上進(jìn)行選擇性官能團(tuán)化的方法。這些方法極大地促進(jìn)了天然產(chǎn)物“后期多樣化衍生策略” (late-stage diversification)的發(fā)展?;谠谔烊划a(chǎn)物后期多樣化衍生方面的出色工作,近期北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院雷曉光課題組在美國化學(xué)會旗艦期刊ACS Central Science上發(fā)表了兩篇背靠背文章,詳細(xì)闡述了“后期多樣化衍生策略”在天然產(chǎn)物合成與創(chuàng)新藥物研發(fā)中的應(yīng)用。

在第一篇以“Chrysomycin A Derivatives for the Treatment of Multidrug Resistant Tuberculosis”為標(biāo)題的研究論文中(DOI10.1021/acscentsci.0c00122),雷曉光課題組首先利用有效的“連續(xù)碳-氫鍵活化策略”(sequential C-H functionalizations實(shí)現(xiàn)了一類結(jié)構(gòu)新穎、獨(dú)特的碳-芳基糖苷類天然產(chǎn)物chrysomycin Apolycarcin Vgilvocarcin V的高效全合成(圖一)。整個合成路線簡潔、高效,只利用了10步化學(xué)轉(zhuǎn)化就實(shí)現(xiàn)了三個復(fù)雜天然產(chǎn)物分子的“克級”全合成,比起之前其他課題組所報道的合成路線(18-30步),在合成效率上有了非常大的提高。

圖一天然產(chǎn)物chrysomycin A、polycarcin Vgilvocarcin V的高效全合成

 

在全合成基礎(chǔ)之上,雷曉光課題組進(jìn)一步利用“后期多樣化衍生策略”,對天然產(chǎn)物進(jìn)行了大量的結(jié)構(gòu)優(yōu)化、改造。利用多種不同的直接官能團(tuán)化合成方法,包括美國Scripps研究所余金權(quán)教授課題組所開發(fā)出的“間位選擇性碳-氫鍵活化策略”(Wang, P. et al,J. Am. Chem. Soc. 2016138, 9269),成功地制備了33個結(jié)構(gòu)新穎的天然產(chǎn)物衍生物(圖二)。通過進(jìn)一步與華東理工大學(xué)的張立新教授課題組合作,研究者發(fā)現(xiàn)該類天然產(chǎn)物及其衍生物具有很好的抗結(jié)核桿菌的活性。

 

 

圖二:利用天然產(chǎn)物“后期多樣化衍生策略”制備多個天然產(chǎn)物衍生物

 

肺結(jié)核病已經(jīng)成為目前全球每年致死人數(shù)排名第一的傳染性疾病,每年會導(dǎo)致大約1000萬人的新增感染病例以及180萬人的死亡病例。此外,多藥耐藥性和極端耐藥性結(jié)核桿菌的出現(xiàn),為結(jié)核病的治療帶來了更加嚴(yán)峻的挑戰(zhàn)。在過去的40年中,只有兩個治療多藥耐藥性結(jié)核病的創(chuàng)新藥物被開發(fā)出來。但是,考慮到臨床試驗(yàn)的高消耗率,開發(fā)更為有效、且具有新的生物作用機(jī)制的抗結(jié)核藥物,以克服目前廣泛產(chǎn)生的耐藥性是全球的迫切需求。

在此研究中,雷曉光課題組與合作者發(fā)現(xiàn)天然產(chǎn)物chrysomycin A 1)對于野生型和多個臨床分離的多藥耐藥結(jié)核桿菌細(xì)胞株都具有良好的抑制活性(MIC=0.4 ?g/mL)。進(jìn)一步對新合成的、結(jié)構(gòu)新穎的天然產(chǎn)物衍生物的活性測試發(fā)現(xiàn),衍生物(+)-64的活性比起原始天然產(chǎn)物有5倍的提高(MIC=0.08 ?g/mL)。令人興奮的是,該類天然產(chǎn)物和衍生物在不同細(xì)胞株上都沒有展示出明顯的耐藥性,暗示著這類天然產(chǎn)物很有可能是具有全新的生物作用機(jī)制(圖三)。目前,雷曉光課題組正在進(jìn)一步開展后繼的化學(xué)生物學(xué)研究,希望可以發(fā)現(xiàn)該類天然產(chǎn)物的生物靶點(diǎn)并詳細(xì)闡明抗菌的分子機(jī)制。同時,雷曉光課題組也在積極地推進(jìn)基于該類天然產(chǎn)物的后期創(chuàng)新藥物開發(fā)。

 

 圖三發(fā)現(xiàn)多個抗耐藥結(jié)核桿菌的候選藥物分子

在該文章中,雷曉光課題組博士生吳凡和已經(jīng)畢業(yè)的張靜博士,以及中科院微生物所的宋福行研究員為文章共同第一作者,雷曉光教授為通訊作者。此外,華東理工大學(xué)的張立新教授科研團(tuán)隊(duì),美國Scripps研究所的余金權(quán)教授,以及雷曉光課題組博士生王三山也為該工作做出了重要貢獻(xiàn)。該工作主要得到科技部重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國家自然科學(xué)基金、北京市卓越青年科學(xué)家項(xiàng)目,以及北大清華生命科學(xué)聯(lián)合研究中心的資助。

在第二篇以Late-Stage Diversification of Natural Products為標(biāo)題的展望型綜述(Outlook)中(DOI10.1021/acscentsci.9b00916),雷曉光課題組應(yīng)邀撰寫文章,詳細(xì)總結(jié)了天然產(chǎn)物后期多樣化衍生的發(fā)展歷史并同時展望了未來的應(yīng)用前景。該綜述強(qiáng)調(diào)該策略在合成方法學(xué)的發(fā)展、藥物先導(dǎo)化合物的優(yōu)化、生物靶標(biāo)的鑒定、蛋白-蛋白相互作用的調(diào)控、以及天然產(chǎn)物生物合成途徑探索等方面的重要作用。文章同時指出天然產(chǎn)物后期多樣化衍生策略的廣泛應(yīng)用仍然受制于目前合成方法在選擇性等方面所存在的問題,仍需要進(jìn)一步的發(fā)展高選擇性的化學(xué)方法和催化劑,其中選擇性C-H鍵活化方法、光催化方法、以及生物催化方法 (biocatalysis) 在這一領(lǐng)域具有巨大的發(fā)展前景(圖四)。為了充分挖掘天然產(chǎn)物后期多樣化衍生的應(yīng)用價值,各個領(lǐng)域需加強(qiáng)合作。隨著化學(xué)方法的豐富,天然產(chǎn)物后期多樣化衍生的新機(jī)遇和新應(yīng)用也將不斷涌現(xiàn)。

圖四:不同合成方法在天然產(chǎn)物后期多樣化衍生中的應(yīng)用

在該綜述文章中,雷曉光課題組畢業(yè)博士生洪本科博士為文章第一作者,雷曉光教授為通訊作者。北京大學(xué)化學(xué)院羅佗平教授在文章撰寫過程中給予了重要幫助。該工作也得到國家自然科學(xué)基金、科技部重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、北京市卓越青年科學(xué)家項(xiàng)目、以及北大-清華生命聯(lián)合中心的資助。

 

以上兩篇文章將在2020年5月出版的ACS Central Science期刊上作為封面文章一起發(fā)表。

文章鏈接:

1. https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acscentsci.0c00122

2. https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acscentsci.9b00916


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