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鐘芳銳/吳鈺周/陳希Nat Catal:三重態(tài)光酶“區(qū)室化”不對(duì)稱能量轉(zhuǎn)移催化

來(lái)源:化學(xué)加APP      2025-10-27
導(dǎo)讀:自然界利用區(qū)室化機(jī)制在空間上隔離互不兼容的生化反應(yīng)。受此啟發(fā),華中科技大學(xué)鐘芳銳教授、吳鈺周教授與西北大學(xué)陳希教授合作團(tuán)隊(duì),在Nat Catal上發(fā)表研究,提出了 “三重態(tài)光酶區(qū)室化能量轉(zhuǎn)移催化” 新策略。該策略通過(guò)將遺傳編碼的人工三重態(tài)光酶與外部定制的三重態(tài)淬滅劑相結(jié)合,成功解決了不對(duì)稱光催化中因底物直接激發(fā)而導(dǎo)致的外消旋背景反應(yīng)難題。研究系統(tǒng)展示了該策略在多種[2+2]光環(huán)加成反應(yīng)中的普適性,并進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)了連續(xù)流放大合成與活體細(xì)胞內(nèi)的光生物催化,為發(fā)展精準(zhǔn)、高效的人工光酶催化體系提供了新范式。

一、研究背景與挑戰(zhàn)

不對(duì)稱催化是現(xiàn)代合成化學(xué)中制備手性分子的核心技術(shù)。在傳統(tǒng)熱催化中,手性催化劑通過(guò)降低反應(yīng)活化能壘,選擇性活化與之結(jié)合的底物,從而實(shí)現(xiàn)手性誘導(dǎo)。然而,在光催化反應(yīng),特別是通過(guò)能量轉(zhuǎn)移(EnT)途徑進(jìn)行的反應(yīng)中,一個(gè)根本性挑戰(zhàn)在于:在非選擇性的光照條件下,游離于催化劑之外的底物同樣會(huì)被激發(fā),進(jìn)而發(fā)生非手性的背景反應(yīng),導(dǎo)致產(chǎn)物對(duì)映選擇性下降。

盡管通過(guò)開(kāi)發(fā)親和性手性光敏劑或底物發(fā)色團(tuán)活化等策略,已在特定體系中實(shí)現(xiàn)了激發(fā)態(tài)的對(duì)映選擇性控制,但這些方法通常要求底物的吸收波長(zhǎng)與光敏劑有顯著差異。對(duì)于吸收光譜與光敏劑重疊或更長(zhǎng)的底物,其直接激發(fā)導(dǎo)致的背景反應(yīng)難以避免。

鐘芳銳和吳鈺周團(tuán)隊(duì)在前期的研究中,基于基因密碼子擴(kuò)展技術(shù)構(gòu)建了“三重態(tài)人工光酶”(Nature, 2022, 611, 715,Nature:首例光酶催化對(duì)映選擇性[2+2]-環(huán)加成反應(yīng)),利用能量轉(zhuǎn)移活化的空間鄰近依賴性和酶空腔的限域效應(yīng),實(shí)現(xiàn)了能量轉(zhuǎn)移催化吲哚底物的對(duì)映選擇性[2+2]環(huán)加成。這類光酶可利用其固有的手性空腔,通過(guò)多重非共價(jià)相互作用精確排列底物與光敏劑,實(shí)現(xiàn)高效的能量轉(zhuǎn)移與優(yōu)異的立體控制,例如用于對(duì)映選擇性[2+2]光環(huán)加成反應(yīng)。然而,BpA輔因子的固有吸收范圍(365–390 nm)限制了其應(yīng)用,且對(duì)于在此窗口內(nèi)有吸收的底物,背景反應(yīng)問(wèn)題依然突出。


二、研究策略與設(shè)計(jì)理念

為解決上述挑戰(zhàn),本研究從自然界的區(qū)室化概念中獲得靈感,提出了一個(gè)集成解決方案:利用蛋白質(zhì)空腔對(duì)反應(yīng)體系進(jìn)行物理空間上的分割,創(chuàng)造一個(gè)獨(dú)特的、與外部本體溶液分離的封閉酶腔。

·酶腔內(nèi)部(催化區(qū)室): 在蛋白質(zhì)空腔內(nèi),遺傳編碼的BpA光敏劑與底物在限域的手性環(huán)境中近距離接近,促進(jìn)高效且受保護(hù)的能量轉(zhuǎn)移過(guò)程,實(shí)現(xiàn)對(duì)映選擇性催化。

·本體溶液(淬滅區(qū)室): 在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域外的溶液中,通過(guò)引入精心設(shè)計(jì)的三重態(tài)淬滅劑,利用碰撞淬滅機(jī)制抑制游離底物因直接激發(fā)而產(chǎn)生的背景反應(yīng)。

該設(shè)計(jì)的核心在于,通過(guò)蛋白質(zhì)的物理屏障和理性設(shè)計(jì)的淬滅劑,實(shí)現(xiàn)“腔內(nèi)外”反應(yīng)路徑的精準(zhǔn)調(diào)控,在促進(jìn)腔內(nèi)手性反應(yīng)的同時(shí),抑制腔外的外消旋路徑。

鐘芳銳教授團(tuán)隊(duì)2026年招收有機(jī)合成化學(xué)、生物催化、人工智能背景的博士生和博士后,目前實(shí)驗(yàn)室經(jīng)費(fèi)充足,歡迎感興趣的有志之士直接聯(lián)系鐘老師chemzfr@hust.edu.cn.

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1.人工光酶“區(qū)室化”催化的概念

三、實(shí)驗(yàn)結(jié)果與討論

1. 概念驗(yàn)證與光酶庫(kù)初篩

研究選取了1-萘酚衍生物1a作為模型底物,因其在300-390 nm的紫外吸收與BpA嚴(yán)重重疊。實(shí)驗(yàn)證實(shí),在365 nm光照下,1a存在顯著的非催化背景反應(yīng)(37%產(chǎn)率),且該反應(yīng)可被氧氣(一種已知的三重態(tài)淬滅劑)有效抑制,表明背景反應(yīng)經(jīng)由底物的三重態(tài)進(jìn)行。

為尋找合適的光酶平臺(tái),研究團(tuán)隊(duì)構(gòu)建了一個(gè)包含LmrR、CgmR、RamR、QacR、TM1030和tHisF六種不同蛋白質(zhì)骨架、共24個(gè)BpA嵌入突變體的光酶庫(kù)。在高通量篩選后,發(fā)現(xiàn)基于RamR蛋白的變體,特別是RamR_F155BpA(命名為RamR1.0),在催化1a的[2+2]光環(huán)加成中展現(xiàn)出最優(yōu)的活性和對(duì)映選擇性(厭氧條件下37%產(chǎn)率,30% e.e.)。

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2. 光酶酶庫(kù)的構(gòu)建與篩選

2. 三重態(tài)淬滅劑的理性設(shè)計(jì)與優(yōu)化

在確認(rèn)RamR1.0的催化能力后,研究系統(tǒng)評(píng)估了不同淬滅劑對(duì)反應(yīng)的影響。

·氧氣: 在空氣和氧氣氛圍下,反應(yīng)的e.e.值分別提升至34%和46%,印證了區(qū)室化淬滅的概念。然而,氧氣同時(shí)引發(fā)了底物和產(chǎn)物的氧化副反應(yīng),導(dǎo)致質(zhì)量平衡下降。

·常規(guī)小分子淬滅劑: 測(cè)試了(E)-1,2-二苯乙烯(TQ1)、2,5-二甲基己-2,4-二烯(TQ2)和苝(TQ3)。盡管TQ1和TQ2能提升e.e.值,但它們嚴(yán)重抑制了轉(zhuǎn)化率,推測(cè)是由于這些疏水性小分子可自由進(jìn)入酶腔,干擾了內(nèi)部的EnT過(guò)程。

·定制化淬滅劑: 為克服上述限制,團(tuán)隊(duì)設(shè)計(jì)了(E)-4-苯乙烯基苯甲酸(TQ4)。在反應(yīng)pH條件下,TQ4的羧基處于去質(zhì)子化狀態(tài),帶負(fù)電。由于RamR活性中心入口周圍富集了多個(gè)帶負(fù)電荷的酸性氨基酸殘基(如Glu129, Asp132等),靜電排斥作用阻止了TQ4進(jìn)入酶腔,使其能夠選擇性地淬滅溶液中的激發(fā)態(tài)底物。實(shí)驗(yàn)結(jié)果證實(shí),TQ4在顯著提升對(duì)映選擇性的同時(shí),保持了良好的反應(yīng)性和質(zhì)量平衡。

·大分子淬滅劑: 進(jìn)一步合成了二苯乙烯功能化的牛血清白蛋白(BSA-TQ1),利用其巨大的分子尺寸實(shí)現(xiàn)空間排斥,同樣取得了成功。

瞬態(tài)吸收光譜分析為區(qū)室化保護(hù)提供了直接證據(jù):RamR1.0-BpA的激發(fā)態(tài)壽命在氧氣存在下幾乎不變,而游離BpA的壽命則被氧氣顯著淬滅,表明蛋白質(zhì)空腔有效保護(hù)了內(nèi)部光敏劑免受外部淬滅劑的影響。

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3. 三重態(tài)淬滅劑的概念驗(yàn)證

3. 蛋白質(zhì)工程與催化性能提升

RamR1.0為起點(diǎn),研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)聚焦半理性定點(diǎn)飽和突變對(duì)其進(jìn)行了定向進(jìn)化?;赗amR的晶體結(jié)構(gòu)和分子對(duì)接模擬,對(duì)底物結(jié)合口袋周圍的12個(gè)殘基進(jìn)行突變,最終獲得了最優(yōu)變體RamR3.0(F155BpA/K63R/S67W/S134A)。

RamR3.0與底物1a的復(fù)合物晶體結(jié)構(gòu)(分辨率2.50 ?)揭示了其高選擇性機(jī)制:BpA光敏劑與底物萘環(huán)之間的距離為5.7 ?,確保了高效的三重態(tài)能量轉(zhuǎn)移。突變殘基R63與底物的芐基形成π-陽(yáng)離子相互作用。突變殘基A134與底物的萘基形成π-烷基相互作用。此外,底物還與T55、A110、V138、D152、L156、M184等多個(gè)殘基存在廣泛的非共價(jià)相互作用網(wǎng)絡(luò),包括C-H…π、π-硫、π-σ和π-烷基作用。底物的芐基與BpA之間存在π-π堆積作用。這些相互作用共同將底物穩(wěn)定在特定構(gòu)象,使其烯烴側(cè)鏈優(yōu)先接近萘環(huán)的一個(gè)對(duì)映異位面,從而實(shí)現(xiàn)了高度的立體控制。在TQ4存在下,RamR3.0催化模型反應(yīng)的產(chǎn)率達(dá)70%,對(duì)映選擇性高達(dá)94% e.e.。

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4 人工光酶的定向進(jìn)化和晶體解析

4. 底物普適性與策略通用性

研究考察了RamR3.0-TQ4體系對(duì)多種1-萘酚及2-萘酚衍生物的適用性。結(jié)果表明,帶有不同電性取代基的底物、酚酯、芐酯同系物、含氮雜環(huán)底物以及更具挑戰(zhàn)性的萘基酮類底物,在該體系下大多能以良好至優(yōu)秀的產(chǎn)率和對(duì)映選擇性(多數(shù) >90% e.e.)得到相應(yīng)的環(huán)加成產(chǎn)物。淬滅劑TQ4在所有案例中均一致地提升了產(chǎn)物的立體化學(xué)純度。

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5. 底物普適性

該區(qū)室化策略被證明具有廣泛的通用性:成功應(yīng)用于基于噻噸酮輔因子的人工光酶(CMP4.0)催化的環(huán)加成反應(yīng)。在間歇反應(yīng)和連續(xù)流光反應(yīng)器中均能穩(wěn)定運(yùn)行。在克級(jí)規(guī)模的流動(dòng)化學(xué)合成中,產(chǎn)物2m以98%的分離產(chǎn)率和91% e.e.獲得,展示了其應(yīng)用于規(guī)模化合成的潛力。實(shí)現(xiàn)了全細(xì)胞光生物催化。在表達(dá)RamR光酶的大腸桿菌細(xì)胞內(nèi),盡管胞內(nèi)環(huán)境復(fù)雜,仍能成功實(shí)現(xiàn)1m的光環(huán)加成,獲得73%產(chǎn)率和82% e.e.。添加TQ4后,對(duì)映選擇性進(jìn)一步提升,且細(xì)胞在光照后仍保持高活性(存活率>97%),證明了該策略在生命體系中的適用性。

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6. “空間分區(qū)“光酶催化策略的通用性和兼容性


結(jié)論與展望

本研究成功開(kāi)發(fā)了一種生物催化區(qū)室化策略,通過(guò)整合人工三重態(tài)光酶與定制的三重態(tài)淬滅劑,有效解決了不對(duì)稱能量轉(zhuǎn)移催化中的外消旋背景反應(yīng)這一關(guān)鍵科學(xué)問(wèn)題。該工作不僅拓展了人工光酶的工具箱,更重要的是展示了一種通過(guò)物理空間分區(qū)來(lái)精準(zhǔn)控制光化學(xué)反應(yīng)路徑的創(chuàng)新范式。隨著合成生物學(xué)與蛋白質(zhì)工程技術(shù)的不斷發(fā)展,這種將生物區(qū)室化優(yōu)勢(shì)與合成化學(xué)理性設(shè)計(jì)相結(jié)合的策略,有望在復(fù)雜手性分子的綠色合成、生物相容性光化學(xué)以及細(xì)胞內(nèi)的精準(zhǔn)合成生物學(xué)等領(lǐng)域發(fā)揮重要作用。

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