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五邑大學趙登高和馬燕燕團隊報道了一種高選擇性的口服RET降解劑

來源:五邑大學      2025-01-15
導讀:近日,五邑大學趙登高和馬燕燕團隊在Journal of Medicinal Chemistry期刊上發(fā)表了題為“Discovery of a Selective and Orally Bioavailable RET Degrader with Effectiveness in Various Mutations”的文章,報道了一類能夠克服多種突變,并具有良好口服生物利用度的RET選擇性降解劑RD-23。

正文

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 RET (rearranged during transfection)基因是一種原癌基因,該基因編碼一種位于細胞膜上的受體酪氨酸激酶(RTK)。RET基因的融合和突變會導致多種類型的癌癥,50%的散發(fā)性甲狀腺髓樣癌(MTC)病例中具有RET突變,而在10-20%的乳頭狀甲狀腺癌、1-2%的非小細胞肺癌以及其他惡性腫瘤病例中則表現(xiàn)為RET融合。目前已有幾種激酶抑制劑用于RET相關(guān)癌癥治療:CabozantinibVandetanib用于治療MTC,SorafenibLenvatinib用于治療分化型甲狀腺癌(DTC)。然而,該類抑制劑的靶向性較低,對RET突變體沒有抑制效果,導致臨床治療效果不佳。而新型選擇性RET選擇性抑制劑selpercatinib(LOXO-292)pralsetinib(BLU-667)能夠有效抑制野生型RETV804L/M突變體。但是與其他激酶抑制劑類似,采用 LOXO-292 治療也會導致獲得性耐藥。臨床前研究發(fā)現(xiàn),采用 LOXO-292 治療具有 RET 融合的非小細胞肺癌患者可能會出現(xiàn) G810R/S/C 溶劑前沿突變,從而導致耐藥。因此,目前亟需開發(fā)新的策略克服RET抑制劑耐藥性。小分子蛋白降解劑是一種新的藥物設(shè)計策略,具有靶向不可成藥靶點、克服突變及不易產(chǎn)生耐藥性等優(yōu)勢。提高口服生物利用度是目前小分子蛋白降解劑面臨的重要挑戰(zhàn)。

作者基于PROTAC技術(shù),選擇LOXO-292作為RET招募配體,并發(fā)現(xiàn)2-羥基-2-甲基丙氧基是溶劑暴露的,在此基礎(chǔ)上設(shè)計了12兩種結(jié)構(gòu)骨架用于Linker連接,另外選用CRBN和VHL作為E3連接酶。測試細胞則選用了伴有KIF5B-RET基因融合的Ba/F3細胞。

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在合成的一系列PROTAC分子中,RD-23能夠有效抑制Ba/F3-RET, Ba/F3-RETV804M和Ba/F3-RETG810C細胞的生長。對沒有RET基因融合的細胞,RD-23的細胞毒性很弱,這些結(jié)果體現(xiàn)了RD-23的靶向選擇性。此外,RD-23能夠以濃度依賴以及時間依賴的方式有效實現(xiàn)Ba/F3-KIF5B-RET細胞和Ba/F3-KIF5BRETG810C中的RET降解。

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作用機制研究表明,RD-23基于泛素-溶酶體途徑誘導RET蛋白降解,并且以濃度依賴的方式有效抑制下游Shc的磷酸化。

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計算機模擬發(fā)現(xiàn)RD-23能夠有效嵌入RET和CRBN之間的凹槽并形成穩(wěn)定的三元復合物。

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蛋白質(zhì)組學分析表明,RD-23能夠選擇性降解RET蛋白。在激酶選擇性測試中,RD-23也表現(xiàn)出優(yōu)秀的RET激酶選擇性對其他激酶沒有明顯的抑制活性。

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RD-23表現(xiàn)出良好的藥代動力學特性,口服生物利用度達到了40.3%。因此,作者選擇以10 mg/kg的劑量,口服給藥測試RD-23對Ba/F3-KIF5B-RETG810C異種移植模型的抗腫瘤活性。結(jié)果表明RD-23具有優(yōu)異的抗腫瘤活性(qd= 62.3%,bid = 85.1%),在給藥期間沒有造成顯著的體重下降,更重要的是,在腫瘤組織中也實現(xiàn)了RET蛋白的有效降解。

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總結(jié)

綜上,RD-23是一類能夠特異性降解RET蛋白的PROTAC分子,對多種RET突變體均有效,是首個能夠通過口服給藥方式實現(xiàn)顯著抗腫瘤活性的RET蛋白降解劑。

文獻詳情:

Discovery of a Selective and Orally Bioavailable RET Degrader with Effectiveness in Various Mutations

Mo Hualong,JieYing Liu,Ting Yin,XuXu Cao,ZhengXi Su,Deng-Gao Zhao*,Yan-Yan Ma*

J. Med. Chem. 2025

https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.4c01889

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