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Org.?Process?Res. Dev.:通過DOE抑制 SPPS 中同時 Fmoc-His(Trt)-OH 消旋和 Nα-DIC 封端,其對肽合成中氨基酸活化策略的意義

來源:化學(xué)加網(wǎng)原創(chuàng)      2022-08-05
導(dǎo)讀:在固相多肽合成中偶聯(lián) Fmoc-His(Trt)-OH 經(jīng)常伴隨著明顯的外消旋化。組氨酸是在肽合成中傾向于外消旋的最敏感的氨基酸殘基之一。在本研究中,利用色譜純化不能有效清除D-His外消旋雜質(zhì)。因此,DOE被使用以降低該His外消旋 。導(dǎo)出的 DOE 模型揭示了 Fmoc-His(Trt)-OH 的預(yù)活化對其外消旋產(chǎn)生重要影響。強化 Fmoc-His(Trt)-OH 預(yù)活化會激化這種副反應(yīng)。另一方面,沒有氨基酸預(yù)活化,采用 in situ Fmoc-Xaa-OH活化,另一個副反應(yīng),即N,N二異丙基碳二亞胺封端(Nα-DIC-封端)被提升。組氨酸消旋化和多肽 Nα 封端之間存在矛盾關(guān)系通過 DOE 調(diào)查發(fā)現(xiàn)。建立了組氨酸消旋和多肽Nα-DICF封端的重要模型在此基礎(chǔ)上完成封端和調(diào)和以平衡這兩種副反應(yīng)。

正文


介紹
Fmoc-His(Trt)-OH 是最容易外消旋的多肽合成中的氨基酸。如此高的不穩(wěn)定性是主要歸因于其側(cè)鏈不受保護的咪唑基Nπ可以在分子內(nèi) 進攻Hα ,而后者的酸度會隨著 Fmoc-His(Trt)-OH的活化而增強。所得碳負(fù)離子的再質(zhì)子化導(dǎo)致 His-Cα 消旋化(Scheme 1)。

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Scheme 1. Fmoc-His(Trt)-OH 活化和由 His-Nτ 引導(dǎo)的偶聯(lián)過程中組氨酸的消旋化。
總的來說,在 多肽固相合成(SPPS) 中可實施兩種氨基酸活化策略,即原位 in situ活化和預(yù)活化。在原位活化策略中,將 Fmoc-Xaa-OH 和偶聯(lián)劑依次添加到底物肽樹脂中,而無需預(yù)先混合。Fmoc-Xaa-OH在偶聯(lián)試劑存在下 與肽-Nα 的偶聯(lián)以一鍋法發(fā)生。因此,在原位活化策略中,活化的 Fmoc-Xaa-OH 的存在期被最小化。反之,當(dāng)采用預(yù)活化策略時,F(xiàn)moc-Xaa-OH 和偶聯(lián)劑在偶聯(lián)反應(yīng)之前混合。預(yù)活化過程通常需要幾分鐘才能將 Fmoc-Xaa-OH 轉(zhuǎn)化為其相應(yīng)的活化物質(zhì)。當(dāng)預(yù)活化到期時,將活化的 Fmoc-Xaa-OH 添加到肽樹脂中以啟動目標(biāo)偶聯(lián)反應(yīng)。
盡管原位活化策略可以有效縮短活化的 Fmoc-Xaa-OH 物種的存在期,這可能有助于緩解氨基酸外消旋化,但預(yù)活化策略仍被工業(yè)界廣泛采用。這是考慮到偶聯(lián)試劑和肽-Nα 部分之間的副反應(yīng)導(dǎo)致的肽鏈終止,uronium和碳二亞胺偶聯(lián)劑可以將伯氨基和仲氨基轉(zhuǎn)化為相應(yīng)的胍物質(zhì)(Scheme 2)。
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Scheme 2. DIC 介導(dǎo)的 Fmoc-Xaa-OH 活化/偶聯(lián)和封端終止肽鏈副反應(yīng)
結(jié)果與討論
在該研究項目中,一個Fmoc-His(Trt)-OH 縮合反應(yīng)所導(dǎo)致的消旋化副反應(yīng)被以DOE的方式進行研究優(yōu)化。DIC/HOBt被用作縮合試劑和縮合添加劑。已知氨基酸預(yù)活化溫度、時間和偶聯(lián)反應(yīng)溫度對于氨基酸偶聯(lián)的各種特征雜質(zhì)的形成具有潛在的關(guān)鍵性。在全因子DOE (full factorial design)設(shè)計中,三個研究參數(shù)的范圍,即耦合溫度、預(yù)活化溫度和預(yù)活化時間,指定為[10°C,30°C],[10°C,30 °C] 和 [1 分鐘,20 分鐘]??偣矊嵤┝?11 次實驗,包括整個設(shè)計空間的三個中心點復(fù)制,以測試曲率并估計純誤差。設(shè)計的響應(yīng)包括 D-His(Trt) 和 DIC-封端 雜質(zhì)。11個DOE實驗結(jié)果在Table 1中顯示。
Table 1. DIC/HOBt·H2O 的 Fmoc-His(Trt)-OH 耦合的 DOE實驗結(jié)果

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D-His 模型
D-His 模型(Figure 1)顯示,預(yù)活化時間和預(yù)活化溫度在 Fmoc-His(Trt)-OH 消旋化中起最重要的作用。此外,預(yù)活化溫度和預(yù)活化時間之間的相互作用強烈影響 D-His 雜質(zhì)含量。其他重要因素,即耦合溫度以及耦合溫度和預(yù)活化時間之間的相互作用,影響相對較小。這些發(fā)現(xiàn)在機制上是合理的,因為氨基酸的外消旋化主要發(fā)生在其羧酸鹽被活化時。氨基酸被預(yù)活化的程度越強,例如在高溫下和預(yù)活化時間延長,其外消旋作用就越大。
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Figure 1. D-His 雜質(zhì)與預(yù)活化溫度/預(yù)活化時間的 3D 表面圖(耦合溫度恒定為 20 °C)。
鑒于預(yù)活化時間的突出關(guān)鍵性,需要將此參數(shù)控制在低水平,以確保 D-His 雜質(zhì)低于目標(biāo)含量 2.0%。一旦預(yù)活化時間為一分鐘,預(yù)測的 D-His 雜質(zhì)含量將在設(shè)計空間內(nèi)一致小于 2.0%。如果預(yù)活化溫度和偶聯(lián)溫度都設(shè)置在低水平,它甚至可以降低到 1.0% 以下。如果將預(yù)活化時間延長至十分鐘,則組氨酸外消旋化保持在2.0%以下的概率將大大降低,而當(dāng)預(yù)活化超過二十分鐘時,這一目標(biāo)幾乎無法實現(xiàn)(Figure 2)。
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Figure 2. D-His 雜質(zhì)與耦合溫度/預(yù)活化溫度的 3D 表面和等高線圖,預(yù)活化時間為常數(shù)(從左到右分別為 1、10、20 分鐘)。
DIC-封端 模型
DIC-封端模型表明,預(yù)活化時間是DIC 封端副反應(yīng)的最關(guān)鍵參數(shù),其次是耦合溫度。與 D-His 模型相反,預(yù)活化溫度和預(yù)活化時間對 DIC 封端的主要影響為負(fù),表明通過單獨增加預(yù)活化溫度或預(yù)活化時間 的方法,DIC-封端雜質(zhì)會減少(Figure 3)。
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Figure 3. DIC 封端雜質(zhì)與預(yù)活化溫度/預(yù)活化時間的 3D 表面圖(耦合溫度恒定為 20 °C)。

總結(jié)

Fmoc-His(Trt)-OH在偶聯(lián)反應(yīng)過程中高度傾向于消旋化。本研究中的 D-His 肽雜質(zhì)對純化過程提出了明顯的挑戰(zhàn)。通過DIC/HOBt·H2O/DMF耦合方法三因子兩水平全因子DOE設(shè)計,對 Fmoc-His(Trt)-OH 偶聯(lián)進行了優(yōu)化,以將外消旋化降低到 2.0%。所有三個研究的參數(shù),即耦合溫度、預(yù)活化溫度和預(yù)活化時間,在D-His以及DIC-封端的兩個模型中都很重要,并且預(yù)活化時間在這兩種情況下都是最顯著的因素。雙因素相互作用(耦合溫度*預(yù)活化時間)和(預(yù)活化溫度*預(yù)活化時間)對 D-His 模型是顯著的,而(耦合溫度*預(yù)活化溫度)對于 DIC 封端模型是顯著的。預(yù)活化時間/預(yù)活化溫度與 D-His/DIC 封端之間的相關(guān)性是相反的。更長的預(yù)活化時間和預(yù)活化溫度將減弱 DIC 封端,但會加劇組氨酸外消旋化。

鑒于在本研究中 D-His 抑制比 DIC 封端具有更高的優(yōu)先級,因此設(shè)置了有利于 D-His 最小化的工藝參數(shù)。輪廓圖疊加方法被操縱以針對能夠同時滿足 D-His (2.0%) 和 DIC 封端 (0.2%) 目標(biāo)的參數(shù)設(shè)置。

具體來說,本研究最突出的發(fā)現(xiàn)總結(jié)如下:

? 組氨酸消旋取決于偶聯(lián)劑/添加劑和活化策略。

? 高溫和長時間的強化預(yù)活化會加劇組氨酸外消旋化。

DIC 封端伴隨氨基酸偶聯(lián)過程中的氨基酸外消旋。

? 通過提高預(yù)活化溫度和延長預(yù)活化時間進行充分的氨基活化可以減少 DIC 封端和其他相關(guān)副反應(yīng)。

文獻(xiàn)詳情:

Yi Yang*, Lena Hansen, Alberto Baldi. Suppression of Simultaneous Fmoc-His(Trt)-OH Racemization and Nα-DIC-Endcapping in Solid-Phase Peptide Synthesis through Design of Experiments and Its Implication for an Amino Acid Activation Strategy in Peptide Synthesis. Organic Process Research & Development. 2022. https://doi.org/10.1021/acs.oprd.2c00144 

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