?;鶊F是許多活性天然產(chǎn)物的藥效基團,催化?;M裝的轉移酶因其寬泛的底物選擇性成為藥物研發(fā)中化合物結構多樣性研究的重要工具酶,但目前對于其底物選擇性的分子機制研究報道較少。二十四元大環(huán)內酯類抗生素Macrolactins(MLNs)有多種藥理學活性,其中帶有丙二?;揎椇顽牾;揎椀腗LNs對多種多重耐藥菌具有良好的抑制作用,然而其酰基化后修飾機制尚不清楚。
該研究采用體內遺傳學、體外酶學、蛋白晶體學等手段,以海洋芽孢桿菌B-9987為研究對象,首次系統(tǒng)闡明了MLNs酰基化后修飾步驟,發(fā)現(xiàn)β-內酰胺酶同源蛋白BmmI能夠特異性選擇帶有羧基末端的?;w,并對?;w和?;荏w顯示出較寬的底物選擇性。為了探究BmmI的底物選擇分子機制,作者解析了BmmI與琥珀?;矁r連接的蛋白質結構,發(fā)現(xiàn)一個特殊的“氧陰離子穴”類似結構扮演了?;wgatekeeper的角色,通過設計“粗調”和“微調”方案對該“氧陰離子穴”結構進行了理性改造,成功拓寬了BmmI酰基供體選擇性。該研究還解析了BmmI與MLN A的復合物蛋白質結構,揭示了?;荏w的結合方式,闡明了BmmI催化?;磻姆肿訖C制。該研究系統(tǒng)闡釋了?;D移酶底物選擇性的分子機制,為酶的理性設計與改造提供了理論指導,也為創(chuàng)新藥物研發(fā)提供了有力工具。

BmmI特殊的“氧陰離子穴”類似結構及其理性改造
中國海洋大學劉揚博士、李花月副教授,中國科學院青島生物能源與過程研究所東升副研究員、馮銀鋼研究員、崔球研究員和北京大學云彩虹教授為論文共同作者,該研究工作得到了國家重點研發(fā)計劃和國家自然科學基金等項目資助。李文利課題組長期致力于海洋微生物次級代謝產(chǎn)物合成生物學研究,在J. Am. Chem. Soc.、Nat. Commun.等發(fā)表SCI研究論文50余篇,受邀在Trends Biochem. Sci.(IF=16.889)上發(fā)表綜述“Next-Generation Drug Discovery to Combat Antimicrobial Resistance”,被推選榮獲Thieme Chemistry Journals Award 2020獎項。
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